Находясь в "Диспетчере файлов" cPanel зайдите в разделе "Параметр"
В открывшемся окне нас интересует параметр "Показывать скрытые файлы"
Ставим галочку и нажимаем "Save"
Теперь нам видны и доступны для редактирования скрытые файлы такие как .ftpquota, .htaccess и пр.